Но не только лекарственная устойчивость туберкулезных бактерий препятствует осуществлению эффективности специфической терапии. Плохая и полная непереносимость антибиотиков и химических препаратов этими больными — обычное явление, обусловленное не только свойствами препаратов, но и измененной реактивностью организма, снижением антитоксической и выделительной функций печени и почек, недостаточностью надпочечников, белковой дистрофией, нарушением витаминного баланса, сопутствующими болезнями органов пищеварения и т. п. Снижение функции внешнего дыхания в связи с выключением значительной части легких (множественные каверны, хирургические и коллапсо-терапевтические вмешательства, пневмосклероз и т. п.), сердечная недостаточность — оказывают отрицательное влияние на окислительные процессы, ухудшают переносимость препаратов.
Деформированное бронхиальное дерево, бронхоэктазы, каверны, нарушение вентиляции создают благоприятные условия для вегетирования нетуберкулезной флоры, которая поддерживает вялотекущее неспецифическое воспаление с периодическими вспышками. Очаги туберкулезного и неспецифического воспаления являются постоянными продуцентами аутоантигенов и причиной целой цепи аутоиммунных патологических реакций. Иммунологические исследования больных хроническим и гиперхроническим деструктивным туберкулезом с применением легочных и специфических антигенов показали, что появление аутоантител в крови сопутствует прогрессирующему деструктивному процессу с острым или подострым течением. При воспалительных реакциях подобного типа освобождаются биологически активные вещества типа гистамина, серотонина и др., обусловливающие во многом клиническую симптоматику (бронхоспазм, астматический бронхит, аллергические реакции на антибиотики).