Аэробные и факультативные грамположительные кокки
- Семейство Micrococcaceae
- Род Staphylococcus, Род Stomatococcus
- Семейство Streptococcaceae
- Род Streptococcus, Род Enterococcus,
- Род Aerococcus, Leuconostoc, Pediococcus, Lactococcus
Аэробные и факультативно анаэробные грамположительные палочки
- Спорообразующие бактерии:
- Спорообразующие бактерии правильной формы
- Род Listeria, Род Lactobacillus
- Спорообразующие бактерии неправильной формы
- Род Corynebacterium
- Нокардиоформные актиномицеты
Анаэробные грамположительные бактерии
- Спорообразующие бактерии рода Clostridium
- Род Actinomyces
Анаэробные грамотрицательные кокки рода Neisseria
- Neisseria gonorrhoeae
- Neisseria meningitides
Аэробные неферментирующие грамотрицательные палочки и коккобациллы
- Род Pseudomonas,
- Род Acinetobacter,
- Род Moraxella и др.
Прихотливые аэробные грамотрицательные палочки и коккобациллы
- Род Francisella,
- Род Brucella,
- Род Bordetella,
- Род Legionella
Факультативные грамотрицательные палочки: бактерии семейства Enterobacteriaceae
- Род Escherichia,
- Род Shigella,
- Род Salmonella,
- Род Yersinia,
- Род Klebsiella,
- Род Enterobacter,
- Род Citrobacter,
- Род Proteus,
- Род Morganella
Факультативные грамотрицательные палочки: бактерии семейства Vibrionaceae
- Род Vibrio,
- Род Aeromonas,
- Род Plesiomonas
Факультативные грамотрицательные палочки: гемоглобинофильные бактерии и близкие виды
- Род Haemophilus,
- Род Gardnerella,
- Род Pasteurella,
- Род Actinobacillus,
- Род Cardiobacterium,
- Род Chromobacterium,
- Род Eikenella,
- Род Capnocytophaga
Микроаэрофильные грамотрицательные палочки родов Campylobacter и Helicobacter
- Род Campylobacter,
- Род Helicobacter
Анаэробные грамотрицательные бактерии
- Род Bacteroides,
- Род Porphyromonas,
- Род Prevotella,
- Род Fusobacterium
- Род Mobiluncus,
- Род Veillonella
Грамотрицательные палочки с неясным систематическим положением
- Calymmatobacterium granulomatis
- Streptobacillus moniliformis
- Afipia felis
Спирохеты
- Род Treponema
- Род Borrelia
- Род Leptospira
Микобактерии
- Патогенные микобактерии
- Атипичные микобактерии
Микоплазмы
- Род Mycoplasma
- Род Ureaplasma
Внутриклеточные паразиты: бактерии семейств Chlamydiae, Rickettsiacea и Bartonellaceae
- Семейство Chlamydiae
- Семейство Rickettsiaceae
- Семейство Bartonellaceae